FISH法 とは?ページ内リンク ↓ウィキペディア(Wikipedia)記事 ↓Yahoo!知恵袋FISH(fluorescence in situ hybridization)法とは、蛍光 in situ ハイブリダイゼーションのことで、蛍光物質や酵素などで標識したオリゴヌクレオチドプローブを用い、目的の遺伝子とハイブリダイゼーションさせ蛍光顕微鏡で検出する手法である。医学分野等では遺伝子のマッピングや染色体異常の検出などで用いられている。また微生物学分野では真正細菌・古細菌の16Sまたは23S rRNAの特異的な配列と相補的なオリゴヌクレオチドプローブを使用し、微生物の群集構造を解析する手法としても用いられている。 出典: 『ウィキペディア(Wikipedia)』 関連商品
Micro Fish /
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目次 |
| プローブ名 | 配列(5'-3') | 結合部位 | 対象細菌 | 参考 | |
|---|---|---|---|---|---|
| EUB338 | GCTGCCTCCCGTAGGAGT | 16S, 338–355 | 真正細菌 | Amann, R. I. et al (1990) | |
| ALF1b | CGTTCGYTCTGAGCCAG | 16S, 19–35 | α-プロテオバクテリア | Manz, W. et al (1992) | |
| BET42a | GCCTTCCCACTTCGTTT | 23S, 1027–1043 | β-プロテオバクテリア | Manz, W. et al. (1992) | |
| GAM42a | GCCTTCCCACATCGTTT | 23S, 1027–1043 | γ-プロテオバクテリア | Manz, W. et al. (1992) | |
| CF319a | TGGTCCGTGTCTCAGTAC | 16S, 319–336 | サイトファーガ-フラボバクテリア | Manz, W. et al. (1996) | |
| HGCGP | TATAGTTACCACCGCCGT | 23S, 1901-1918 | 高GCグラム陽性菌 | Roller, C. et al. (1994) | |
| LGC354b | CGGAAGATTCCCTACTGC | 16S, 354–371 | 低GCグラム陽性菌 | Meier, H. et al. (1999) |
プローブの標識に使用される代表的な蛍光色素
Cy3, Cy5, FITC etc
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